Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms