Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NEDD8Q15843 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NEDD8Q15843 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NEDD8Q15843 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NEDD8Q15843 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NEDD8Q15843 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NEDD8Q15843 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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