Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms