Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYTH1Q15438 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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