Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HERC3Q15034 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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