Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHPRHQ149N8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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