Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms