Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM29Q14134 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms