Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms