Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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