Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TSTA3Q13630 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSTA3Q13630 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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