Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR3Q13615 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms