Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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