Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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