Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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