Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM32Q13049 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms