Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FOXF2Q12947 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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