Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
STX4Q12846 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
STX4Q12846 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
STX4Q12846 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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