Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms