Protein–RNA interactions for Protein: P86790

CCZ1B, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1BP86790 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCZ1BP86790 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms