Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMF1P82094 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMF1P82094 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMF1P82094 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms