Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL23P55773 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL23P55773 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms