Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms