Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms