Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPAP53621 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPAP53621 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPAP53621 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms