Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNJ1P48048 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNJ1P48048 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms