Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms