Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJC1P36383 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJC1P36383 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJC1P36383 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJC1P36383 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJC1P36383 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJC1P36383 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GJC1P36383 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms