Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms