Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDCP19113 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDCP19113 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms