Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms