Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRAFP15056 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRAFP15056 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms