Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CCL2P13500 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CCL2P13500 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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