Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms