Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms