Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QRK9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QRK9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms