Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZNF879B4DU55 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms