Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSDA5PKW4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms