Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TARSL2A2RTX5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms