Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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