Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TRAF6Q9Y4K3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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