Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms