Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB23Q9ULC3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB23Q9ULC3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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