Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP2BPQ9P2M1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP2BPQ9P2M1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms