Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC180Q9P1Z9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms