Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COX16Q9P0S2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms