Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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