Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATG3Q9NT62 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms