Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms