Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPERQ9BY12 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms